Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms