Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms