Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLK1P49759 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLK1P49759 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLK1P49759 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLK1P49759 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLK1P49759 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLK1P49759 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLK1P49759 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLK1P49759 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLK1P49759 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLK1P49759 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CLK1P49759 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CLK1P49759 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CLK1P49759 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CLK1P49759 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLK1P49759 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLK1P49759 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLK1P49759 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLK1P49759 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLK1P49759 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLK1P49759 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLK1P49759 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLK1P49759 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLK1P49759 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLK1P49759 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLK1P49759 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLK1P49759 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLK1P49759 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLK1P49759 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLK1P49759 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLK1P49759 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLK1P49759 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLK1P49759 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLK1P49759 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLK1P49759 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLK1P49759 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLK1P49759 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLK1P49759 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLK1P49759 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLK1P49759 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLK1P49759 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLK1P49759 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLK1P49759 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CLK1P49759 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLK1P49759 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLK1P49759 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLK1P49759 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLK1P49759 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLK1P49759 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLK1P49759 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLK1P49759 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CLK1P49759 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLK1P49759 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLK1P49759 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLK1P49759 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLK1P49759 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLK1P49759 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLK1P49759 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLK1P49759 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLK1P49759 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLK1P49759 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLK1P49759 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLK1P49759 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLK1P49759 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLK1P49759 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLK1P49759 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLK1P49759 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLK1P49759 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLK1P49759 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CLK1P49759 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLK1P49759 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLK1P49759 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CLK1P49759 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLK1P49759 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLK1P49759 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLK1P49759 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLK1P49759 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLK1P49759 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLK1P49759 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLK1P49759 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLK1P49759 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLK1P49759 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLK1P49759 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLK1P49759 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLK1P49759 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLK1P49759 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLK1P49759 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLK1P49759 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLK1P49759 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLK1P49759 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLK1P49759 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLK1P49759 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLK1P49759 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLK1P49759 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLK1P49759 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLK1P49759 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLK1P49759 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLK1P49759 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLK1P49759 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLK1P49759 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms