Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRIM1P49642 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms