Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTBP49356 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTBP49356 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTBP49356 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTBP49356 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTBP49356 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTBP49356 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTBP49356 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTBP49356 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTBP49356 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTBP49356 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTBP49356 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTBP49356 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTBP49356 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTBP49356 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTBP49356 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTBP49356 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTBP49356 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTBP49356 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTBP49356 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTBP49356 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTBP49356 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTBP49356 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTBP49356 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTBP49356 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTBP49356 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTBP49356 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTBP49356 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTBP49356 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTBP49356 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTBP49356 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTBP49356 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTBP49356 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTBP49356 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTBP49356 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTBP49356 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTBP49356 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTBP49356 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTBP49356 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTBP49356 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTBP49356 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTBP49356 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTBP49356 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTBP49356 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTBP49356 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTBP49356 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTBP49356 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTBP49356 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTBP49356 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTBP49356 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTBP49356 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTBP49356 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTBP49356 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTBP49356 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTBP49356 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTBP49356 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTBP49356 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FNTBP49356 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FNTBP49356 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
FNTBP49356 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FNTBP49356 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FNTBP49356 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FNTBP49356 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTBP49356 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTBP49356 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTBP49356 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTBP49356 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTBP49356 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTBP49356 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTBP49356 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTBP49356 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTBP49356 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTBP49356 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTBP49356 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTBP49356 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTBP49356 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTBP49356 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTBP49356 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTBP49356 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTBP49356 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTBP49356 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTBP49356 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTBP49356 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTBP49356 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTBP49356 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTBP49356 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTBP49356 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTBP49356 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTBP49356 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTBP49356 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTBP49356 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTBP49356 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTBP49356 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTBP49356 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTBP49356 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTBP49356 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTBP49356 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTBP49356 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTBP49356 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTBP49356 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms