Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FNTAP49354 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNTAP49354 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FNTAP49354 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FNTAP49354 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNTAP49354 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNTAP49354 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNTAP49354 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNTAP49354 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNTAP49354 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FNTAP49354 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
FNTAP49354 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FNTAP49354 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FNTAP49354 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FNTAP49354 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FNTAP49354 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
FNTAP49354 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FNTAP49354 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNTAP49354 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNTAP49354 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNTAP49354 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FNTAP49354 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNTAP49354 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FNTAP49354 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNTAP49354 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FNTAP49354 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNTAP49354 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNTAP49354 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FNTAP49354 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNTAP49354 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNTAP49354 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNTAP49354 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FNTAP49354 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNTAP49354 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FNTAP49354 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNTAP49354 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FNTAP49354 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNTAP49354 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FNTAP49354 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNTAP49354 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNTAP49354 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FNTAP49354 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNTAP49354 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FNTAP49354 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNTAP49354 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNTAP49354 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FNTAP49354 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FNTAP49354 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNTAP49354 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FNTAP49354 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FNTAP49354 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNTAP49354 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FNTAP49354 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FNTAP49354 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FNTAP49354 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FNTAP49354 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FNTAP49354 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FNTAP49354 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FNTAP49354 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FNTAP49354 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
FNTAP49354 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FNTAP49354 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FNTAP49354 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FNTAP49354 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FNTAP49354 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTAP49354 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTAP49354 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTAP49354 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTAP49354 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTAP49354 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTAP49354 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTAP49354 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTAP49354 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTAP49354 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTAP49354 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTAP49354 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTAP49354 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTAP49354 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTAP49354 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTAP49354 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTAP49354 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTAP49354 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTAP49354 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTAP49354 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTAP49354 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTAP49354 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTAP49354 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTAP49354 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTAP49354 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTAP49354 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTAP49354 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTAP49354 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTAP49354 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTAP49354 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTAP49354 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTAP49354 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTAP49354 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTAP49354 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTAP49354 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTAP49354 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms