Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK8P49336 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK8P49336 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK8P49336 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK8P49336 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK8P49336 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK8P49336 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK8P49336 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK8P49336 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK8P49336 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK8P49336 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK8P49336 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK8P49336 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK8P49336 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK8P49336 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK8P49336 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK8P49336 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK8P49336 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK8P49336 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK8P49336 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK8P49336 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK8P49336 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK8P49336 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK8P49336 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK8P49336 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK8P49336 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK8P49336 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK8P49336 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK8P49336 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK8P49336 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK8P49336 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK8P49336 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK8P49336 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK8P49336 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK8P49336 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK8P49336 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK8P49336 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK8P49336 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK8P49336 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK8P49336 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK8P49336 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK8P49336 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK8P49336 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK8P49336 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK8P49336 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK8P49336 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK8P49336 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK8P49336 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDK8P49336 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CDK8P49336 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK8P49336 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK8P49336 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK8P49336 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK8P49336 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK8P49336 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK8P49336 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK8P49336 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK8P49336 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK8P49336 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK8P49336 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK8P49336 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK8P49336 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK8P49336 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK8P49336 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK8P49336 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK8P49336 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK8P49336 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK8P49336 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK8P49336 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK8P49336 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK8P49336 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK8P49336 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK8P49336 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK8P49336 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK8P49336 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK8P49336 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK8P49336 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK8P49336 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK8P49336 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK8P49336 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK8P49336 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK8P49336 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK8P49336 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK8P49336 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK8P49336 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK8P49336 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK8P49336 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK8P49336 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK8P49336 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK8P49336 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK8P49336 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK8P49336 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK8P49336 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK8P49336 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK8P49336 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK8P49336 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK8P49336 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK8P49336 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK8P49336 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK8P49336 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms