Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RXRGP48443 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RXRGP48443 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RXRGP48443 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RXRGP48443 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RXRGP48443 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RXRGP48443 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RXRGP48443 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RXRGP48443 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RXRGP48443 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RXRGP48443 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RXRGP48443 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RXRGP48443 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RXRGP48443 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RXRGP48443 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RXRGP48443 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RXRGP48443 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RXRGP48443 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RXRGP48443 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RXRGP48443 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RXRGP48443 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RXRGP48443 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RXRGP48443 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RXRGP48443 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RXRGP48443 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RXRGP48443 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RXRGP48443 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RXRGP48443 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RXRGP48443 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RXRGP48443 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RXRGP48443 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RXRGP48443 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RXRGP48443 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RXRGP48443 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RXRGP48443 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RXRGP48443 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RXRGP48443 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RXRGP48443 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RXRGP48443 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RXRGP48443 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RXRGP48443 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RXRGP48443 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RXRGP48443 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RXRGP48443 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RXRGP48443 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RXRGP48443 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RXRGP48443 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RXRGP48443 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RXRGP48443 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RXRGP48443 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RXRGP48443 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RXRGP48443 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RXRGP48443 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RXRGP48443 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RXRGP48443 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RXRGP48443 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RXRGP48443 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RXRGP48443 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RXRGP48443 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RXRGP48443 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RXRGP48443 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RXRGP48443 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RXRGP48443 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RXRGP48443 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RXRGP48443 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RXRGP48443 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RXRGP48443 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RXRGP48443 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RXRGP48443 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RXRGP48443 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RXRGP48443 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RXRGP48443 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RXRGP48443 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RXRGP48443 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RXRGP48443 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RXRGP48443 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
RXRGP48443 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RXRGP48443 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RXRGP48443 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RXRGP48443 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RXRGP48443 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RXRGP48443 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RXRGP48443 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RXRGP48443 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RXRGP48443 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RXRGP48443 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RXRGP48443 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RXRGP48443 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RXRGP48443 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RXRGP48443 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RXRGP48443 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RXRGP48443 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RXRGP48443 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RXRGP48443 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RXRGP48443 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RXRGP48443 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RXRGP48443 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RXRGP48443 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RXRGP48443 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RXRGP48443 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms