Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms