Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIA2P42262 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIA2P42262 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIA2P42262 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIA2P42262 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA2P42262 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA2P42262 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA2P42262 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA2P42262 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA2P42262 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA2P42262 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA2P42262 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA2P42262 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA2P42262 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA2P42262 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA2P42262 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA2P42262 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA2P42262 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA2P42262 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA2P42262 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA2P42262 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA2P42262 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIA2P42262 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIA2P42262 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIA2P42262 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIA2P42262 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIA2P42262 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA2P42262 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms