Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms