Protein–RNA interactions for Protein: P36075

CUE2, Ubiquitin-binding protein CUE2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE2P36075 INO4YOL108C 456 nt3.18□□□□□ -1.9
CUE2P36075 PIS1YPR113W 663 nt3.18□□□□□ -1.9
CUE2P36075 MET10YFR030W 3108 nt3.18□□□□□ -1.9
CUE2P36075 YGR237CYGR237C 2358 nt3.18□□□□□ -1.9
CUE2P36075 SEC15YGL233W 2733 nt3.18□□□□□ -1.9
CUE2P36075 YNL193WYNL193W 1677 nt3.17□□□□□ -1.9
CUE2P36075 YRR1YOR162C 2433 nt3.17□□□□□ -1.9
CUE2P36075 SDH6YDR379C-A 240 nt3.17□□□□□ -1.9
CUE2P36075 HMF1YER057C 390 nt3.17□□□□□ -1.9
CUE2P36075 RPL9BYNL067W 576 nt3.17□□□□□ -1.9
CUE2P36075 YDL180WYDL180W 1644 nt3.17□□□□□ -1.9
CUE2P36075 UTP13YLR222C 2454 nt3.17□□□□□ -1.9
CUE2P36075 HUL5YGL141W 2733 nt3.17□□□□□ -1.9
CUE2P36075 PSP1YDR505C 2526 nt3.16□□□□□ -1.9
CUE2P36075 PET191YJR034W 327 nt3.16□□□□□ -1.9
CUE2P36075 RPL15AYLR029C 615 nt3.16□□□□□ -1.9
CUE2P36075 YLR230WYLR230W 306 nt3.16□□□□□ -1.9
CUE2P36075 YLR416CYLR416C 399 nt3.16□□□□□ -1.9
CUE2P36075 RPL6BYLR448W 531 nt3.16□□□□□ -1.9
CUE2P36075 snR48snR48 113 nt3.16□□□□□ -1.9
CUE2P36075 RPN1YHR027C 2982 nt3.15□□□□□ -1.9
CUE2P36075 SHQ1YIL104C 1524 nt3.15□□□□□ -1.9
CUE2P36075 NDD1YOR372C 1665 nt3.15□□□□□ -1.9
CUE2P36075 YFR054CYFR054C 579 nt3.15□□□□□ -1.91
CUE2P36075 IRC18YJL037W 675 nt3.15□□□□□ -1.91
CUE2P36075 MDV1YJL112W 2145 nt3.15□□□□□ -1.91
CUE2P36075 VBA4YDR119W 2307 nt3.15□□□□□ -1.91
CUE2P36075 YLL032CYLL032C 2478 nt3.15□□□□□ -1.91
CUE2P36075 TAF2YCR042C 4224 nt3.14□□□□□ -1.91
CUE2P36075 YHR080CYHR080C 4038 nt3.14□□□□□ -1.91
CUE2P36075 snR68snR68 136 nt3.14□□□□□ -1.91
CUE2P36075 RAD6YGL058W 519 nt3.14□□□□□ -1.91
CUE2P36075 HHF2YNL030W 312 nt3.14□□□□□ -1.91
CUE2P36075 IRC23YOR044W 474 nt3.14□□□□□ -1.91
CUE2P36075 YPL229WYPL229W 621 nt3.14□□□□□ -1.91
CUE2P36075 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt3.14□□□□□ -1.91
CUE2P36075 YCK2YNL154C 1641 nt3.14□□□□□ -1.91
CUE2P36075 ALG8YOR067C 1734 nt3.13□□□□□ -1.91
CUE2P36075 CHS3YBR023C 3498 nt3.13□□□□□ -1.91
CUE2P36075 ARP7YPR034W 1434 nt3.13□□□□□ -1.91
CUE2P36075 RRM3YHR031C 2172 nt3.13□□□□□ -1.91
CUE2P36075 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt3.13□□□□□ -1.91
CUE2P36075 PHD1YKL043W 1101 nt3.13□□□□□ -1.91
CUE2P36075 SIP18YMR175W 240 nt3.13□□□□□ -1.91
CUE2P36075 TRS65YGR166W 1683 nt3.13□□□□□ -1.91
CUE2P36075 SYO1YDL063C 1863 nt3.13□□□□□ -1.91
CUE2P36075 SPC72YAL047C 1869 nt3.13□□□□□ -1.91
CUE2P36075 TOM70YNL121C 1854 nt3.13□□□□□ -1.91
CUE2P36075 ATG26YLR189C 3597 nt3.13□□□□□ -1.91
CUE2P36075 VAS1YGR094W 3315 nt3.13□□□□□ -1.91
CUE2P36075 RIM13YMR154C 2184 nt3.12□□□□□ -1.91
CUE2P36075 SRC1YML034W 2505 nt3.12□□□□□ -1.91
CUE2P36075 YFR056CYFR056C 369 nt3.12□□□□□ -1.91
CUE2P36075 YGR242WYGR242W 309 nt3.12□□□□□ -1.91
CUE2P36075 SDH2YLL041C 801 nt3.12□□□□□ -1.91
CUE2P36075 CHO2YGR157W 2610 nt3.12□□□□□ -1.91
CUE2P36075 REG1YDR028C 3045 nt3.11□□□□□ -1.91
CUE2P36075 YDR340WYDR340W 303 nt3.11□□□□□ -1.91
CUE2P36075 ALG13YGL047W 609 nt3.11□□□□□ -1.91
CUE2P36075 YGL149WYGL149W 306 nt3.11□□□□□ -1.91
CUE2P36075 YIL012WYIL012W 342 nt3.11□□□□□ -1.91
CUE2P36075 COA4YLR218C 453 nt3.11□□□□□ -1.91
CUE2P36075 TMA10YLR327C 261 nt3.11□□□□□ -1.91
CUE2P36075 ILV5YLR355C 1188 nt3.11□□□□□ -1.91
CUE2P36075 YBL073WYBL073W 312 nt3.11□□□□□ -1.91
CUE2P36075 RPL20BYOR312C 519 nt3.11□□□□□ -1.91
CUE2P36075 YPL238CYPL238C 390 nt3.11□□□□□ -1.91
CUE2P36075 snR49snR49 165 nt3.11□□□□□ -1.91
CUE2P36075 KAP104YBR017C 2757 nt3.11□□□□□ -1.91
CUE2P36075 MCD1YDL003W 1701 nt3.1□□□□□ -1.91
CUE2P36075 FLO5YHR211W 3228 nt3.1□□□□□ -1.91
CUE2P36075 RCY1YJL204C 2523 nt3.1□□□□□ -1.91
CUE2P36075 YDL062WYDL062W 426 nt3.1□□□□□ -1.91
CUE2P36075 YDL211CYDL211C 1119 nt3.1□□□□□ -1.91
CUE2P36075 IRC4YDR540C 540 nt3.1□□□□□ -1.91
CUE2P36075 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt3.1□□□□□ -1.91
CUE2P36075 YHR212CYHR212C 336 nt3.1□□□□□ -1.91
CUE2P36075 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt3.1□□□□□ -1.91
CUE2P36075 YAR060CYAR060C 336 nt3.1□□□□□ -1.91
CUE2P36075 YAR068WYAR068W 486 nt3.1□□□□□ -1.91
CUE2P36075 RPS7BYNL096C 573 nt3.1□□□□□ -1.91
CUE2P36075 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt3.1□□□□□ -1.91
CUE2P36075 DAD3YBR233W-A 285 nt3.1□□□□□ -1.91
CUE2P36075 FAR1YJL157C 2493 nt3.1□□□□□ -1.91
CUE2P36075 EAP1YKL204W 1899 nt3.09□□□□□ -1.91
CUE2P36075 FUS1YCL027W 1539 nt3.09□□□□□ -1.91
CUE2P36075 UBP5YER144C 2418 nt3.09□□□□□ -1.91
CUE2P36075 YDR344CYDR344C 444 nt3.09□□□□□ -1.91
CUE2P36075 RRT13YER066W 558 nt3.09□□□□□ -1.91
CUE2P36075 PAU14YIL176C 363 nt3.09□□□□□ -1.91
CUE2P36075 PHS1YJL097W 654 nt3.09□□□□□ -1.91
CUE2P36075 PAU1YJL223C 363 nt3.09□□□□□ -1.91
CUE2P36075 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.09□□□□□ -1.91
CUE2P36075 YAT2YER024W 2772 nt3.09□□□□□ -1.92
CUE2P36075 YKU70YMR284W 1809 nt3.08□□□□□ -1.92
CUE2P36075 ICR1ICR1 3199 nt3.08□□□□□ -1.92
CUE2P36075 YER076W-AYER076W-A 348 nt3.08□□□□□ -1.92
CUE2P36075 YJL150WYJL150W 303 nt3.08□□□□□ -1.92
CUE2P36075 RPA12YJR063W 378 nt3.08□□□□□ -1.92
CUE2P36075 YNL179CYNL179C 438 nt3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.5 ms