Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE6BP35913 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms