Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP7BP35670 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP7BP35670 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP7BP35670 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP7BP35670 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP7BP35670 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP7BP35670 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP7BP35670 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP7BP35670 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP7BP35670 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP7BP35670 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP7BP35670 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP7BP35670 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP7BP35670 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP7BP35670 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP7BP35670 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP7BP35670 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7BP35670 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7BP35670 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7BP35670 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7BP35670 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7BP35670 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7BP35670 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7BP35670 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7BP35670 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7BP35670 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP7BP35670 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms