Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms