Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD12P35452 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms