Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms