Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CLIP1P30622 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms