Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC27P30260 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC27P30260 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC27P30260 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC27P30260 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC27P30260 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC27P30260 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC27P30260 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC27P30260 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC27P30260 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC27P30260 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC27P30260 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC27P30260 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC27P30260 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC27P30260 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC27P30260 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC27P30260 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC27P30260 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC27P30260 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC27P30260 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC27P30260 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC27P30260 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC27P30260 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC27P30260 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC27P30260 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC27P30260 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC27P30260 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC27P30260 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC27P30260 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC27P30260 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC27P30260 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC27P30260 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC27P30260 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC27P30260 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC27P30260 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC27P30260 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC27P30260 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC27P30260 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC27P30260 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC27P30260 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC27P30260 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC27P30260 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC27P30260 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC27P30260 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC27P30260 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC27P30260 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC27P30260 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC27P30260 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC27P30260 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC27P30260 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC27P30260 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC27P30260 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC27P30260 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC27P30260 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC27P30260 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC27P30260 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC27P30260 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC27P30260 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC27P30260 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC27P30260 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC27P30260 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC27P30260 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC27P30260 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC27P30260 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC27P30260 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC27P30260 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC27P30260 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC27P30260 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC27P30260 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC27P30260 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC27P30260 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC27P30260 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC27P30260 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC27P30260 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC27P30260 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC27P30260 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC27P30260 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC27P30260 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC27P30260 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC27P30260 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC27P30260 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC27P30260 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC27P30260 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC27P30260 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC27P30260 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC27P30260 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC27P30260 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC27P30260 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC27P30260 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC27P30260 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC27P30260 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC27P30260 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC27P30260 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC27P30260 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC27P30260 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC27P30260 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC27P30260 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC27P30260 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC27P30260 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC27P30260 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms