Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms