Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID4AP29374 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms