Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD38P28907 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD38P28907 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD38P28907 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD38P28907 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD38P28907 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD38P28907 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD38P28907 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD38P28907 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD38P28907 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD38P28907 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD38P28907 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD38P28907 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD38P28907 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD38P28907 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD38P28907 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD38P28907 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD38P28907 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD38P28907 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD38P28907 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD38P28907 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD38P28907 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD38P28907 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD38P28907 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD38P28907 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CD38P28907 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CD38P28907 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CD38P28907 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD38P28907 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD38P28907 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD38P28907 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD38P28907 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD38P28907 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD38P28907 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD38P28907 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD38P28907 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD38P28907 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD38P28907 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD38P28907 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD38P28907 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD38P28907 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD38P28907 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD38P28907 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD38P28907 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CD38P28907 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD38P28907 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD38P28907 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CD38P28907 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD38P28907 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD38P28907 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD38P28907 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD38P28907 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD38P28907 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD38P28907 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD38P28907 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD38P28907 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD38P28907 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD38P28907 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD38P28907 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD38P28907 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD38P28907 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD38P28907 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD38P28907 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD38P28907 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CD38P28907 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD38P28907 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD38P28907 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD38P28907 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD38P28907 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD38P28907 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD38P28907 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD38P28907 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CD38P28907 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD38P28907 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD38P28907 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD38P28907 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD38P28907 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD38P28907 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD38P28907 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CD38P28907 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD38P28907 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD38P28907 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD38P28907 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD38P28907 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD38P28907 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD38P28907 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD38P28907 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD38P28907 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD38P28907 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD38P28907 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD38P28907 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CD38P28907 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CD38P28907 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD38P28907 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD38P28907 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD38P28907 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD38P28907 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD38P28907 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD38P28907 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD38P28907 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms