Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXP28300 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LOXP28300 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LOXP28300 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
LOXP28300 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXP28300 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXP28300 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXP28300 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXP28300 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXP28300 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXP28300 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXP28300 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXP28300 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXP28300 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXP28300 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXP28300 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXP28300 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXP28300 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXP28300 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXP28300 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXP28300 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXP28300 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXP28300 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXP28300 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LOXP28300 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXP28300 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXP28300 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXP28300 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXP28300 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXP28300 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXP28300 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXP28300 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXP28300 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXP28300 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXP28300 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXP28300 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXP28300 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXP28300 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXP28300 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXP28300 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXP28300 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXP28300 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXP28300 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXP28300 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXP28300 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXP28300 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXP28300 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXP28300 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXP28300 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXP28300 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXP28300 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXP28300 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXP28300 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXP28300 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXP28300 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXP28300 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXP28300 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXP28300 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXP28300 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXP28300 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXP28300 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXP28300 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXP28300 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXP28300 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXP28300 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXP28300 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXP28300 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXP28300 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXP28300 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXP28300 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXP28300 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXP28300 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXP28300 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXP28300 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXP28300 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXP28300 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXP28300 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXP28300 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXP28300 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXP28300 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXP28300 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXP28300 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXP28300 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXP28300 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXP28300 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXP28300 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXP28300 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXP28300 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXP28300 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXP28300 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXP28300 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXP28300 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXP28300 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXP28300 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXP28300 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXP28300 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXP28300 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXP28300 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXP28300 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXP28300 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms