Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms