Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSSP25774 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSSP25774 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSSP25774 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSSP25774 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSSP25774 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSSP25774 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSSP25774 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSSP25774 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSSP25774 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSSP25774 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSSP25774 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSSP25774 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSSP25774 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSSP25774 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSSP25774 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSSP25774 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSSP25774 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSSP25774 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSSP25774 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSSP25774 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSSP25774 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSSP25774 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSSP25774 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSSP25774 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSSP25774 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSSP25774 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSSP25774 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSSP25774 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSSP25774 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSSP25774 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSSP25774 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSSP25774 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSSP25774 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSSP25774 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSSP25774 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSSP25774 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSSP25774 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSSP25774 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSSP25774 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSSP25774 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSSP25774 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSSP25774 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSSP25774 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSSP25774 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSSP25774 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSSP25774 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSSP25774 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSSP25774 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSSP25774 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSSP25774 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSSP25774 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSSP25774 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSSP25774 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSSP25774 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSSP25774 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSSP25774 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSSP25774 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSSP25774 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSSP25774 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSSP25774 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSSP25774 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSSP25774 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSSP25774 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSSP25774 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSSP25774 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSSP25774 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSSP25774 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSSP25774 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSSP25774 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSSP25774 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSSP25774 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSSP25774 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSSP25774 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSSP25774 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSSP25774 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CTSSP25774 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTSSP25774 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSSP25774 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSSP25774 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSSP25774 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSSP25774 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSSP25774 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSSP25774 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSSP25774 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSSP25774 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSSP25774 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSSP25774 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSSP25774 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSSP25774 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSSP25774 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSSP25774 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSSP25774 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSSP25774 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSSP25774 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSSP25774 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSSP25774 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSSP25774 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSSP25774 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSSP25774 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms