Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCM3P25205 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MCM3P25205 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCM3P25205 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MCM3P25205 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCM3P25205 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCM3P25205 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCM3P25205 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCM3P25205 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCM3P25205 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCM3P25205 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MCM3P25205 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCM3P25205 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCM3P25205 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCM3P25205 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCM3P25205 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCM3P25205 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCM3P25205 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCM3P25205 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCM3P25205 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCM3P25205 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCM3P25205 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCM3P25205 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCM3P25205 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCM3P25205 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCM3P25205 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCM3P25205 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCM3P25205 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCM3P25205 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCM3P25205 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCM3P25205 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCM3P25205 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCM3P25205 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCM3P25205 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCM3P25205 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCM3P25205 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCM3P25205 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCM3P25205 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCM3P25205 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCM3P25205 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCM3P25205 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCM3P25205 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCM3P25205 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCM3P25205 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCM3P25205 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCM3P25205 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCM3P25205 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCM3P25205 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCM3P25205 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCM3P25205 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCM3P25205 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCM3P25205 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCM3P25205 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCM3P25205 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MCM3P25205 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCM3P25205 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCM3P25205 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCM3P25205 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCM3P25205 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCM3P25205 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCM3P25205 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCM3P25205 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCM3P25205 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCM3P25205 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MCM3P25205 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCM3P25205 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCM3P25205 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCM3P25205 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCM3P25205 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MCM3P25205 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCM3P25205 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCM3P25205 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCM3P25205 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCM3P25205 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCM3P25205 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCM3P25205 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCM3P25205 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCM3P25205 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCM3P25205 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCM3P25205 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCM3P25205 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCM3P25205 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCM3P25205 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCM3P25205 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCM3P25205 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCM3P25205 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCM3P25205 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCM3P25205 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCM3P25205 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCM3P25205 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCM3P25205 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCM3P25205 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCM3P25205 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MCM3P25205 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCM3P25205 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCM3P25205 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCM3P25205 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCM3P25205 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCM3P25205 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCM3P25205 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms