Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTNP21246 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTNP21246 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTNP21246 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTNP21246 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTNP21246 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTNP21246 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTNP21246 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTNP21246 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTNP21246 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTNP21246 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTNP21246 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTNP21246 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTNP21246 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTNP21246 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTNP21246 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTNP21246 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTNP21246 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTNP21246 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTNP21246 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTNP21246 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTNP21246 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTNP21246 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTNP21246 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTNP21246 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTNP21246 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTNP21246 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTNP21246 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTNP21246 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTNP21246 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTNP21246 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTNP21246 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTNP21246 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTNP21246 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTNP21246 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTNP21246 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTNP21246 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTNP21246 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTNP21246 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTNP21246 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTNP21246 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTNP21246 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTNP21246 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTNP21246 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTNP21246 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTNP21246 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTNP21246 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTNP21246 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTNP21246 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTNP21246 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTNP21246 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTNP21246 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTNP21246 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTNP21246 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTNP21246 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTNP21246 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTNP21246 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTNP21246 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTNP21246 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTNP21246 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTNP21246 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTNP21246 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTNP21246 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTNP21246 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTNP21246 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTNP21246 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTNP21246 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTNP21246 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTNP21246 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTNP21246 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTNP21246 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTNP21246 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTNP21246 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTNP21246 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTNP21246 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTNP21246 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTNP21246 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTNP21246 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTNP21246 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTNP21246 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTNP21246 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTNP21246 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTNP21246 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTNP21246 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTNP21246 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTNP21246 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTNP21246 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTNP21246 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTNP21246 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTNP21246 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTNP21246 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTNP21246 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTNP21246 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTNP21246 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTNP21246 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTNP21246 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTNP21246 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTNP21246 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTNP21246 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTNP21246 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms