Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms