Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMY2BP19961 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMY2BP19961 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMY2BP19961 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMY2BP19961 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMY2BP19961 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMY2BP19961 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMY2BP19961 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMY2BP19961 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMY2BP19961 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMY2BP19961 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMY2BP19961 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMY2BP19961 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMY2BP19961 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMY2BP19961 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMY2BP19961 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMY2BP19961 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMY2BP19961 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMY2BP19961 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AMY2BP19961 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms