Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDCP19113 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDCP19113 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDCP19113 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDCP19113 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDCP19113 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDCP19113 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDCP19113 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDCP19113 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDCP19113 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDCP19113 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDCP19113 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDCP19113 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDCP19113 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDCP19113 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDCP19113 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDCP19113 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDCP19113 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDCP19113 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDCP19113 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDCP19113 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDCP19113 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HDCP19113 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDCP19113 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDCP19113 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HDCP19113 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDCP19113 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDCP19113 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDCP19113 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDCP19113 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDCP19113 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HDCP19113 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDCP19113 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDCP19113 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDCP19113 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDCP19113 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDCP19113 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDCP19113 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDCP19113 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDCP19113 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HDCP19113 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDCP19113 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDCP19113 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDCP19113 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDCP19113 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDCP19113 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDCP19113 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDCP19113 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDCP19113 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDCP19113 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDCP19113 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDCP19113 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDCP19113 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDCP19113 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDCP19113 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDCP19113 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDCP19113 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDCP19113 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDCP19113 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HDCP19113 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDCP19113 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDCP19113 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDCP19113 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDCP19113 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDCP19113 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDCP19113 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDCP19113 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
HDCP19113 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDCP19113 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDCP19113 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HDCP19113 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDCP19113 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDCP19113 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDCP19113 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDCP19113 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDCP19113 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDCP19113 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDCP19113 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HDCP19113 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDCP19113 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDCP19113 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDCP19113 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDCP19113 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDCP19113 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HDCP19113 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HDCP19113 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HDCP19113 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HDCP19113 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDCP19113 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDCP19113 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDCP19113 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDCP19113 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDCP19113 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDCP19113 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDCP19113 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDCP19113 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDCP19113 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDCP19113 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDCP19113 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDCP19113 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms