Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA1P17302 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA1P17302 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA1P17302 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA1P17302 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA1P17302 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA1P17302 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA1P17302 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA1P17302 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA1P17302 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA1P17302 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA1P17302 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA1P17302 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA1P17302 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA1P17302 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA1P17302 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA1P17302 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA1P17302 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA1P17302 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA1P17302 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA1P17302 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA1P17302 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA1P17302 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA1P17302 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA1P17302 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA1P17302 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA1P17302 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA1P17302 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA1P17302 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA1P17302 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA1P17302 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA1P17302 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA1P17302 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA1P17302 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA1P17302 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA1P17302 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA1P17302 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA1P17302 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA1P17302 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA1P17302 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA1P17302 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA1P17302 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA1P17302 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA1P17302 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA1P17302 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA1P17302 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA1P17302 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA1P17302 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA1P17302 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA1P17302 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA1P17302 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA1P17302 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA1P17302 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA1P17302 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA1P17302 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA1P17302 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA1P17302 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA1P17302 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA1P17302 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA1P17302 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA1P17302 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA1P17302 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA1P17302 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA1P17302 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA1P17302 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA1P17302 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA1P17302 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA1P17302 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA1P17302 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA1P17302 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA1P17302 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA1P17302 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA1P17302 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA1P17302 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA1P17302 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA1P17302 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA1P17302 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA1P17302 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA1P17302 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA1P17302 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA1P17302 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA1P17302 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA1P17302 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA1P17302 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA1P17302 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA1P17302 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA1P17302 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA1P17302 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA1P17302 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA1P17302 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA1P17302 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA1P17302 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA1P17302 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA1P17302 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA1P17302 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA1P17302 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA1P17302 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA1P17302 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA1P17302 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA1P17302 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms