Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTLA4P16410 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms