Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA1P15976 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GATA1P15976 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GATA1P15976 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GATA1P15976 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GATA1P15976 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GATA1P15976 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GATA1P15976 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GATA1P15976 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GATA1P15976 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATA1P15976 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATA1P15976 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GATA1P15976 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATA1P15976 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GATA1P15976 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GATA1P15976 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATA1P15976 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATA1P15976 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GATA1P15976 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATA1P15976 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GATA1P15976 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GATA1P15976 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA1P15976 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA1P15976 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GATA1P15976 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA1P15976 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA1P15976 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GATA1P15976 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA1P15976 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GATA1P15976 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA1P15976 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GATA1P15976 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GATA1P15976 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA1P15976 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA1P15976 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA1P15976 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA1P15976 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GATA1P15976 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GATA1P15976 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GATA1P15976 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GATA1P15976 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA1P15976 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GATA1P15976 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATA1P15976 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GATA1P15976 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATA1P15976 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
GATA1P15976 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
GATA1P15976 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA1P15976 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GATA1P15976 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA1P15976 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATA1P15976 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GATA1P15976 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GATA1P15976 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GATA1P15976 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GATA1P15976 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
GATA1P15976 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GATA1P15976 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GATA1P15976 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GATA1P15976 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GATA1P15976 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GATA1P15976 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GATA1P15976 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GATA1P15976 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GATA1P15976 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GATA1P15976 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GATA1P15976 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms