Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRA1P14867 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms