Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL11A1P12107 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL11A1P12107 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL11A1P12107 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL11A1P12107 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL11A1P12107 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL11A1P12107 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL11A1P12107 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL11A1P12107 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL11A1P12107 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL11A1P12107 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL11A1P12107 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL11A1P12107 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL11A1P12107 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms