Protein–RNA interactions for Protein: P0DP09

IGKV1-13, Immunoglobulin kappa variable 1-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-13P0DP09 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGKV1-13P0DP09 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms