Protein–RNA interactions for Protein: P0CG21

NHLRC4, NHL-repeat-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC4P0CG21 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLRC4P0CG21 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLRC4P0CG21 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLRC4P0CG21 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLRC4P0CG21 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLRC4P0CG21 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLRC4P0CG21 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLRC4P0CG21 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLRC4P0CG21 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLRC4P0CG21 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLRC4P0CG21 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLRC4P0CG21 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLRC4P0CG21 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLRC4P0CG21 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLRC4P0CG21 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLRC4P0CG21 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLRC4P0CG21 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLRC4P0CG21 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLRC4P0CG21 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLRC4P0CG21 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLRC4P0CG21 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLRC4P0CG21 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLRC4P0CG21 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLRC4P0CG21 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLRC4P0CG21 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLRC4P0CG21 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms