Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms