Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTAP09496 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTAP09496 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTAP09496 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTAP09496 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTAP09496 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTAP09496 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTAP09496 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTAP09496 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTAP09496 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTAP09496 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTAP09496 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTAP09496 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTAP09496 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTAP09496 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTAP09496 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTAP09496 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTAP09496 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTAP09496 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTAP09496 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTAP09496 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTAP09496 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTAP09496 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTAP09496 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTAP09496 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTAP09496 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTAP09496 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTAP09496 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTAP09496 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTAP09496 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTAP09496 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTAP09496 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTAP09496 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTAP09496 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTAP09496 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTAP09496 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTAP09496 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTAP09496 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTAP09496 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTAP09496 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTAP09496 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTAP09496 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTAP09496 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLTAP09496 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLTAP09496 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLTAP09496 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLTAP09496 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLTAP09496 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLTAP09496 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLTAP09496 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLTAP09496 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLTAP09496 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLTAP09496 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLTAP09496 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTAP09496 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTAP09496 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTAP09496 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTAP09496 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTAP09496 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTAP09496 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTAP09496 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTAP09496 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTAP09496 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTAP09496 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTAP09496 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTAP09496 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTAP09496 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTAP09496 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTAP09496 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTAP09496 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTAP09496 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTAP09496 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTAP09496 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTAP09496 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTAP09496 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTAP09496 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTAP09496 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTAP09496 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTAP09496 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTAP09496 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTAP09496 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTAP09496 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTAP09496 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTAP09496 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTAP09496 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTAP09496 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTAP09496 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTAP09496 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTAP09496 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTAP09496 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTAP09496 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTAP09496 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTAP09496 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTAP09496 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTAP09496 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTAP09496 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTAP09496 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTAP09496 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTAP09496 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTAP09496 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms