Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACAA1P09110 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACAA1P09110 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACAA1P09110 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACAA1P09110 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACAA1P09110 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACAA1P09110 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ACAA1P09110 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACAA1P09110 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACAA1P09110 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACAA1P09110 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACAA1P09110 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACAA1P09110 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACAA1P09110 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACAA1P09110 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACAA1P09110 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACAA1P09110 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACAA1P09110 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACAA1P09110 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACAA1P09110 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ACAA1P09110 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACAA1P09110 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACAA1P09110 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ACAA1P09110 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACAA1P09110 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms