Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3DP05423 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms