Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGAP02671 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGAP02671 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGAP02671 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGAP02671 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGAP02671 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGAP02671 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGAP02671 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGAP02671 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGAP02671 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGAP02671 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGAP02671 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGAP02671 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FGAP02671 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGAP02671 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGAP02671 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGAP02671 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGAP02671 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGAP02671 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGAP02671 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGAP02671 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FGAP02671 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGAP02671 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGAP02671 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGAP02671 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGAP02671 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGAP02671 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FGAP02671 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGAP02671 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGAP02671 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGAP02671 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGAP02671 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGAP02671 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGAP02671 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGAP02671 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGAP02671 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGAP02671 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGAP02671 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGAP02671 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGAP02671 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGAP02671 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGAP02671 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGAP02671 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGAP02671 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGAP02671 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGAP02671 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGAP02671 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGAP02671 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGAP02671 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGAP02671 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGAP02671 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGAP02671 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGAP02671 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FGAP02671 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGAP02671 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGAP02671 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGAP02671 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGAP02671 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FGAP02671 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGAP02671 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGAP02671 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGAP02671 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGAP02671 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGAP02671 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGAP02671 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FGAP02671 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGAP02671 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGAP02671 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGAP02671 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGAP02671 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGAP02671 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGAP02671 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGAP02671 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGAP02671 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGAP02671 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGAP02671 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGAP02671 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGAP02671 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FGAP02671 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGAP02671 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FGAP02671 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGAP02671 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FGAP02671 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGAP02671 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGAP02671 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGAP02671 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGAP02671 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGAP02671 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGAP02671 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGAP02671 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGAP02671 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGAP02671 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGAP02671 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGAP02671 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGAP02671 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGAP02671 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGAP02671 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGAP02671 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FGAP02671 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGAP02671 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms