Protein–RNA interactions for Protein: P01903

HLA-DRA, HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRAP01903 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DRAP01903 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DRAP01903 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms