Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGHG1P01857 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms