Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms