Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D2O95562 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFT2D2O95562 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFT2D2O95562 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFT2D2O95562 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D2O95562 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D2O95562 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D2O95562 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D2O95562 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms