Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24AO95486 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC24AO95486 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms