Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX6O95475 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX6O95475 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX6O95475 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX6O95475 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX6O95475 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX6O95475 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX6O95475 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX6O95475 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX6O95475 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX6O95475 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX6O95475 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX6O95475 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX6O95475 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX6O95475 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX6O95475 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX6O95475 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX6O95475 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX6O95475 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX6O95475 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX6O95475 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX6O95475 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX6O95475 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX6O95475 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX6O95475 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX6O95475 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX6O95475 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX6O95475 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX6O95475 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX6O95475 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX6O95475 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX6O95475 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX6O95475 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX6O95475 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX6O95475 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX6O95475 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX6O95475 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX6O95475 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX6O95475 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX6O95475 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX6O95475 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX6O95475 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX6O95475 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SIX6O95475 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX6O95475 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX6O95475 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX6O95475 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX6O95475 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX6O95475 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX6O95475 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX6O95475 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX6O95475 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX6O95475 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX6O95475 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX6O95475 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX6O95475 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX6O95475 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX6O95475 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX6O95475 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX6O95475 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX6O95475 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX6O95475 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX6O95475 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX6O95475 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX6O95475 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX6O95475 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX6O95475 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX6O95475 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX6O95475 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX6O95475 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX6O95475 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX6O95475 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX6O95475 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX6O95475 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX6O95475 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX6O95475 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX6O95475 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX6O95475 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX6O95475 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX6O95475 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX6O95475 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX6O95475 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX6O95475 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX6O95475 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX6O95475 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX6O95475 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX6O95475 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX6O95475 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX6O95475 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX6O95475 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX6O95475 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX6O95475 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX6O95475 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX6O95475 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX6O95475 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX6O95475 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX6O95475 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX6O95475 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX6O95475 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX6O95475 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms