Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms