Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP19O94966 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP19O94966 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP19O94966 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP19O94966 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP19O94966 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP19O94966 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
USP19O94966 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP19O94966 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP19O94966 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP19O94966 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP19O94966 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP19O94966 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP19O94966 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP19O94966 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP19O94966 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP19O94966 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP19O94966 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP19O94966 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
USP19O94966 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP19O94966 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP19O94966 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP19O94966 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP19O94966 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP19O94966 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP19O94966 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
USP19O94966 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP19O94966 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
USP19O94966 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP19O94966 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP19O94966 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP19O94966 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP19O94966 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP19O94966 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP19O94966 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP19O94966 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP19O94966 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP19O94966 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP19O94966 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP19O94966 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP19O94966 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP19O94966 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP19O94966 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP19O94966 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP19O94966 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP19O94966 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP19O94966 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP19O94966 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP19O94966 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP19O94966 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP19O94966 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP19O94966 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP19O94966 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP19O94966 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP19O94966 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP19O94966 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP19O94966 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
USP19O94966 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP19O94966 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP19O94966 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP19O94966 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP19O94966 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP19O94966 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP19O94966 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP19O94966 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP19O94966 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP19O94966 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP19O94966 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP19O94966 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
USP19O94966 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP19O94966 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP19O94966 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP19O94966 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP19O94966 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP19O94966 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP19O94966 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP19O94966 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP19O94966 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP19O94966 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP19O94966 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP19O94966 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP19O94966 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP19O94966 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP19O94966 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP19O94966 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP19O94966 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP19O94966 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP19O94966 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP19O94966 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP19O94966 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP19O94966 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP19O94966 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
USP19O94966 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP19O94966 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP19O94966 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP19O94966 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP19O94966 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP19O94966 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP19O94966 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP19O94966 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms